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Type: TCC
Title: Avaliação dos níveis de expressão dos genes DDX41 e STING em pacientes portadores de Síndrome Mielodisplásica
Title in Spanish: Evaluación de los niveles de expresión de los genes DDX41 y STING en pacientes con Síndrome Mielodisplásico
Authors: Sampaio, Leticia Rodrigues
Advisor: Pinheiro, Ronald Feitosa
Keywords in Brazilian Portuguese : Síndrome Mielodisplásica;Sistema imune inato;DDX41;STING;Expressão gênica
Keywords in English : Myelodysplastic Syndrome;Innate immune system;DDX41;STING;Gene expression
Knowledge Areas - CNPq: CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
Issue Date: 2021
Citation: SAMPAIO, Leticia Rodrigues. Avaliação dos níveis de expressão dos genes DDX41 e STING em pacientes portadores de Síndrome Mielodisplásica. 2025. 99f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) – Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2021.
Abstract in Brazilian Portuguese: A Síndrome Mielodisplásica (SMD) é uma doença onco-hematológica que atinge a medula óssea e possui caráter heterogêneo. As principais manifestações da doença são a presença de citopenias, displasias de uma ou mais linhagens celulares, hematopoese ineficaz e risco de progressão para leucemia mieloide aguda. O envelhecimento é um dos principais fatores de risco para a doença e por causa disso a incidência da SMD é maior em pessoas idosas. A patogênese da SMD envolve alterações citogenéticas e mutações gênicas em mais de 80% dos casos e genes envolvidos no reparo do DNA, metilação do DNA e splicing de RNA frequentemente estão desregulados na SMD. Além disso, observa-se a superexpressão de genes relacionados ao sistema imune em cerca de 50% dos pacientes, o que resulta em um perfil de estimulação imunológica crônica. O objetivo deste estudo foi avaliar alterações na expressão gênica de dois genes que possuem papel no sistema imune inato: DDX41 e STING em pacientes com SMD. Foram coletadas amostras de medula óssea de 73 indivíduos diagnosticados com SMD em hospital terciário e 4 controles saudáveis. O estudo citogenético foi realizado por banda-G e para analisar os níveis de expressão foi utilizado a metodologia de PCR em tempo real (RT-qPCR). Os níveis de expressão dos genes foram associados com alterações citogenéticas, variáveis clínicas e laboratoriais de impacto prognóstico. Verificamos que DDX41 apresentou maior nível de expressão em pacientes com contagem de blastos na medula óssea superior a 10% em relação aos pacientes que tinham ≤ 2% blastos e entre 5% - 10% de blastos (p=0,002 e p=0,037, respectivamente); maior expressão em pacientes com blastos > 5% em relação a pacientes com blastos ≤ 5% (p=0,017); maior expressão em pacientes com o subtipo SMD-EB2, um subtipo que apresenta maior porcentagem de blastos na medula e possui perfil mais agressivo, em relação a pacientes do subtipo SMD-DM, um subtipo intermediário (p=0,004) e maior expressão em pacientes com formas avançadas da doenças quando comparado com pacientes com formas iniciais da doença (p=0,028). STING apresentou um comportamento similar e observamos maior expressão deste gene em pacientes com contagem de blastos na medula óssea entre 5% - 10% quando comparados aos pacientes que tinham ≤ 2% blastos (p=0,016); maior expressão em pacientes que possuíam 3 citopenias em comparação àqueles que possuíam 1 citopenia (p=0,006); maior expressão em pacientes com o subtipo SMD-EB1, em relação a pacientes do subtipo SMD-SA, um subtipo geralmente menos agressivo (p=0,013); maior expressão em pacientes com formas mais avançadas da SMD, incluindo (p=0,006) ou não o subtipo SMD-DM (0,015) e maior expressão em pacientes agrupados na categoria de risco alto + muito alto em relação a pacientes agrupados na categoria de risco muito baixo + baixo (p=0,006). Nossos achados demonstram que DDX41 e STING podem estar envolvidos na patogênese e evolução da SMD.
Abstract: Myelodysplastic Syndrome (MDS) is an onco-hematological disease that affects the bone marrow and has a heterogeneous character. The main manifestations of the disease are the presence of cytopenias, dysplasia of one or more cell lines, ineffective hematopoiesis and risk of progression to acute myeloid leukemia. Aging is one of the main risk factors for the disease and because of that the incidence of MDS is higher in elderly people. The pathogenesis of MDS involves cytogenetic alterations and gene mutations in more than 80% of cases, and genes involved in DNA repair, DNA methylation and RNA splicing are often unregulated in MDS. Furthermore, overexpression of genes related to the immune system is observed in about 50% of patients, which results in a profile of chronic immune stimulation. The aim of this study was to evaluate changes in gene expression of two genes that play a role in the innate innate system: DDX41 and STING in patients with MDS. Bone marrow samples were collected from 73 individuals diagnosed with MDS at a tertiary hospital and 4 healthy controls. The cytogenetic study was performed by banda-G and to analyze the expression levels the real-time PCR methodology (RT-qPCR) was used. Gene expression levels were associated with cytogenetic alterations, clinical and laboratory variables of prognostic impact. We found that DDX41 had a higher expression level in patients with bone marrow blast counts greater than 10% compared to patients who had ≤ 2% blasts and between 5% - 10% blasts (p=0.002 and p=0.037, respectively) ; greater expression in patients with blasts > 5% compared to patients with blasts ≤ 5% (p=0.017); greater expression in patients with the SMD-EB2 subtype, a subtype that has a higher percentage of blasts in the medulla and has a more aggressive profile, compared to patients of the SMD-DM subtype, an intermediate subtype (p=0.004) and greater expression in patients with advanced forms of the disease when compared to patients with early forms of the disease (p=0.028). STING showed a similar behavior and we observed greater expression of this gene in patients with blast counts in bone marrow between 5% - 10% when compared to patients who had ≤ 2% blasts (p=0.016); greater expression in patients who had 3 cytopenias compared to those who had 1 cytopenia (p=0.006); greater expression in patients with the SMD-EB1 subtype, compared to patients with the SMD-SA subtype, a generally less aggressive subtype (p=0.013); greater expression in patients with more advanced forms of MDS, including (p=0.006) or not the MDS-DM subtype (0.015) and greater expression in patients grouped in the high + very high risk category compared to patients grouped in the risk category very low + low (p=0.006). Ourfindings demonstrate that DDX41 and STING may be involved in the pathogenesis and evolution of MDS.
Abstract in Spanish: El Síndrome Mielodisplásico (SMD) es una enfermedad oncohematológica que afecta a la médula ósea y tiene un carácter heterogéneo. Las principales manifestaciones de la enfermedad son la presencia de citopenias, displasia de una o más líneas celulares, hematopoyesis ineficaz y riesgo de progresión a leucemia mieloide aguda. El envejecimiento es uno de los principales factores de riesgo de la enfermedad y por ello la incidencia de SMD es mayor en las personas mayores. LOS La patogenia del SMD implica alteraciones citogenéticas y mutaciones genéticas en más del 80% de los casos, y los genes implicados en la reparación del ADN, la metilación del ADN y el empalme del ARN a menudo no están regulados en el SMD. Además, la sobreexpresión de genes relacionados con el sistema inmunológico en aproximadamente el 50% de los pacientes, lo que resulta en una perfil de estimulación inmunológica crónica. El objetivo de este estudio fue evaluar los cambios en expresión génica de dos genes que desempeñan un papel en el sistema inmunológico innato: DDX41 y STING en pacientes con SMD. Se recolectaron muestras de médula ósea de 73 individuos diagnosticados con MDS en un hospital terciario y 4 controles sanos. El estudio citogenético se realizó por banda G y para analizar los niveles de expresión se utilizó la metodología de PCR en tiempo real (RT-qPCR). Los niveles de expresión génica se asociaron con alteraciones citogenéticas, variables clínicas y de laboratorio de impacto pronóstico. Encontramos que DDX41 tenía un nivel de expresión más alto en pacientes con recuentos de blastos de médula ósea superiores al 10% en comparación con pacientes que tenían ≤ 2% de blastos y entre 5% y 10% de blastos (p = 0,002 yp = 0,037, respectivamente); mayor expresión en pacientes con blastos> 5% en comparación con pacientes con blastos ≤ 5% (p = 0,017); mayor expresión en pacientes con el subtipo SMD-EB2, subtipo que tiene mayor porcentaje de blastos en la médula y tiene un perfil más agresivo, en comparación con pacientes del subtipo SMD-DM, subtipo intermedio (p = 0,004) y mayor expresión en pacientes con formas avanzadas de la enfermedad en comparación con pacientes con formas tempranas de la enfermedad (p = 0,028). STING mostró un comportamiento similar y observamos una mayor expresión de este gen en pacientes con recuentos de blastos en médula ósea entre 5% - 10% en comparación con pacientes que tenían ≤ 2% de blastos (p = 0,016); mayor expresión en pacientes que tenían 3 citopenias en comparación con los que tenían 1 citopenia (p = 0,006); mayor expresión en pacientes con subtipo SMD-EB1, en comparación con pacientes con subtipo SMD-SA, subtipo generalmente menos agresivo (p = 0,013); mayor expresión en pacientes con formas más avanzadas de SMD, incluyendo (p = 0,006) o no el subtipo SMD-DM (0,015) y mayor expresión en pacientes agrupados en la categoría de alto + muy alto riesgo en comparación con los pacientes agrupados en la categoría de riesgo muy bajo + bajo (p = 0,006). Nuestros hallazgos demuestran que DDX41 y STING pueden estar involucrados en la patogénesis y evolución de MDS.
URI: http://repositorio.ufc.br/handle/riufc/83650
Author's ORCID: https://orcid.org/0000-0002-5784-3135
Author's Lattes: http://lattes.cnpq.br/1950706707532198
Advisor's Lattes: http://lattes.cnpq.br/4755251182720144
Access Rights: Acesso Aberto
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