Please use this identifier to cite or link to this item:
http://repositorio.ufc.br/handle/riufc/75427| Type: | TCC |
| Title: | Bioinformática aplicada à análise da distribuição geográfica de tartarugas marinhas |
| Title in English: | Bioinformatics applied to the analysis of geographic distribution of sea turtles |
| Authors: | Silva, Karen Karoline Abreu da |
| Advisor: | Maggioni, Rodrigo |
| Keywords in Brazilian Portuguese : | Genética da conservação;Dados biológicos;Alinhamento;Testudines |
| Keywords in English : | Conservation genetics;Biological data;Alignment;Testudines |
| Knowledge Areas - CNPq: | CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS |
| Issue Date: | 2023 |
| Citation: | SILVA, Karen Karoline Abreu da. Bioinformática aplicada à análise da distribuição geográfica de tartarugas marinhas. 2023. 61 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Ciências Biológicas) – Centro de Ciências, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2023. |
| Abstract in Brazilian Portuguese: | São identificadas sete espécies de tartarugas marinhas distribuídas globalmente. Há anos tem-se observado o declínio populacional das tartarugas marinhas devido a ações antrópicas, exploração comercial, pesca incidental, ciclo de vida complexo e até hibridização. O seu comportamento filopátrico, a paternidade múltipla e sua capacidade de percorrer milhares de quilômetros por diferentes bacias oceânicas, para alimentação e nidificação facilitaram o fluxo gênico e a colonização de novas regiões. Entretanto, esses fatores dificultam o entendimento acerca dos aspectos biológicos das espécies e impactos antropogênicos. Nesse sentido, as análises genéticas tornaram-se imprescindíveis para caracterização, identificação, comportamento migratório, estudos evolutivos e filogeográficos das espécies. Os avanços nas técnicas de biologia molecular permitiram a criação de marcadores moleculares para avaliação da diversidade genética, taxas evolutivas e estrutura populacional. Os avanços tecnológicos permitiram a criação de programas computacionais para armazenar, comparar dados biológicos em estudos genéticos, permitindo realizar inferências acerca da diversidade e relações evolutivas a partir de sequências genéticas. Portanto, o presente estudo teve por objetivo avaliar a distribuição das espécies com base nas sequências disponibilizadas no banco de dados Genbank para os genes COI, RAG-1 e BDNF. As sequências obtidas pelo GenBank foram alinhadas pelo programa MEGA e utilizados na construção de árvores filogenéticas e rede de haplótipos pelo MEGA e PopArt, respectivamente. Os resultados mostraram relações evolutivas similares aos observados na literatura. Os resultados de filogeografia indicaram possíveis colonizações e fluxo gênico sob influência de aspectos geográficos nas migrações transoceânicas. Observou-se isolamento oceânico em alguns padrões de Chelonia mydas e Eretmochelys imbricata, indicando presença de barreira geográfica. Os resultados podem auxiliar no estabelecimento de padrões de distribuição das espécies e assim auxiliar na elaboração de estratégias de conservação para espécies ameaçadas. |
| Abstract: | There are seven species of sea turtles distributed globally. Sea turtle populations have been declining for years due to anthropogenic actions, commercial exploitation, incidental fishing, a complex life cycle and even hybridization. Their philopatric behavior, multiple paternity and ability to travel thousands of kilometers through different ocean basins to feed and nest have facilitated gene flow and the colonization of new regions. However, these factors make it difficult to understand the biological aspects of the species and anthropogenic impacts. In this sense, genetic analyses have become essential for the characterization, identification, migratory behavior, evolutionary and phylogeographic studies of species. Advances in molecular biology techniques have made it possible to create molecular markers for assessing genetic diversity, evolutionary rates and population structure. Technological advances have enabled the creation of softwares to store and compare biological data in genetic studies, allowing inferences to be made about diversity and evolutionary relationships based on genetic sequences. Therefore, the aim of this study was to evaluate the distribution of species based on the sequences available in the Genbank database for the COI, RAG-1 and BDNF genes. The sequences obtained from GenBank were aligned using the MEGA program and used to build phylogenetic trees and haplotype networks using MEGA and PopArt, respectively. The results showed evolutionary relationships similar to those observed in the literature. The phylogeography results indicated possible colonization and gene flow under the influence of geographical aspects in transoceanic migrations. Oceanic isolation was observed in some patterns of Chelonia mydas and Eretmochelys imbricata, indicating the presence of a geographical barrier. The results may help to establish species distribution patterns and thus assist in the development of conservation strategies for endangered species. |
| URI: | http://repositorio.ufc.br/handle/riufc/75427 |
| Access Rights: | Acesso Aberto |
| Appears in Collections: | CIÊNCIAS BIOLÓGICAS - BACHARELADO - Monografias |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| 2023_tcc_kkasilva.pdf | 1,04 MB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.