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http://repositorio.ufc.br/handle/riufc/35071
Tipo: | TCC |
Título: | Marcadores moleculares para identificação de macroalgas marinhas do Filo Rhodophyta no litoral cearense |
Autor(es): | Ramalho, Rhayan Rocha |
Orientador: | Maggioni, Rodrigo |
Palavras-chave: | Macroalga marinha;Seqüenciamento;Taxonomia vegetal;Rhodophyta;Algas vermelhas |
Data do documento: | 2014 |
Instituição/Editor/Publicador: | Instituto de Ciências do Mar (Labomar) |
Citação: | RAMALHO, R. R. Marcadores moleculares para identificação de macroalgas marinhas do Filo Rhodophyta no litoral cearense. 2014. 38 f. Monografia (Graduação em Oceanografia) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2014. |
Resumo: | As algas vermelhas são organismos essencialmente marinhos, ocorrendo desde regiões tropicais até regiões polares. Dados moleculares empregados no estudo dessas algas são obtidos tanto do genoma do cloroplasto como da mitocôndria e núcleo, mostrando-se úteis na distinção das espécies e na filogenia do grupo. Neste trabalho foram sequenciados marcadores moleculares de macroalgas vermelhas para fins de identificação e avaliação das diferenças populacionais intraespecíficas. Foram realizadas coletas em Fortaleza (praia do Farol e praia do Meireles), em Caucaia (praia do Pacheco) e em Paracuru (praia da Pedra Rachada). Os indivíduos amostrados foram preservados em CTAB e sílica gel, formalina e como exsicatas. O DNA extraído das amostras foi submetido a PCR com primers específicos para cada um de três marcadores moleculares (UPA, rbcL e COI). Produtos de PCR foram sequenciados e as sequências processadas no MEGA, alinhadas por MAFFT e árvores filogenéticas por Neighbor-Joining foram geradas. 13 táxons foram identificados: Agardhiella subulata, Dichotomaria obtusata, Gelidium coarctatum, Gracilaria cornea, G. cervicornis, G. cuneata, G. hayi, G. intermedia, G. yoneshigueana, Gracilariopsis silvana, Hypnea musciformis, Meristotheca sp. e Solieria sp. A máxima divergência intraespecífica observada foi de 1,8%, na espécie H. musciformis. O presente trabalho permitiu a aprendizagem da aquisição e manipulação de dados moleculares para macroalgas vermelhas marinhas no Ceará. Entretanto, observa-se a necessidade da complementação deste trabalho com metodologias de identificação tradicional (morfológica) e do contínuo aprofundamento nos levantamentos florísticos, especialmente na zona infralitoral. |
Abstract: | Red algae are essentially marine organisms that occur from tropical regions all the way to polar regions. Molecular data applied to the study of these algae were obtained from the chloroplast genome, as well as from the mitochondria and the nucleus, and these data are very useful to stablish distinction among species and phylogeny of the group. In this work, we sequenced red macroalgae molecular markers aiming the identification and assessment of the intraspecies populational differences. We collected algae from Fortaleza (Farol beach and Meireles beach), Caucaia (Pacheco beach) and Paracuru (Pedra Rachada beach). Sampled organisms were preserved in CTAB and silica gel, formaldehyde and as exsiccates. The DNA extracted from the samples was used in PCRs with specific primers for each of the three molecular markers (UPA, rbcL and COI). PCR products were sequenced and the sequences processed in MEGA, aligned with MAFFT and phylogenetic trees using Neighbor-Joining were generated. 13 taxa were identified: Agardhiella subulata, Dichotomaria obtusata, Gelidium coarctatum, Gracilaria cornea, G. cervicornis, G. cuneata, G. hayi, G. intermedia, G. yoneshigueana, Gracilariopsis silvana, Hypnea musciformis, Meristotheca sp. e Solieria sp. The max intraspecific divergence observed was of 1.8% in H. musciformis. This work provided grand learning about the processes of acquisition and manipulation of molecular data marine red algae. However, it is necessary to complement it with traditional (morphological) identification methodologies and the continuous deepening of the algal studies, especially in the near shore zone. |
URI: | http://www.repositorio.ufc.br/handle/riufc/35071 |
Aparece nas coleções: | OCEANOGRAFIA - TCC |
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