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dc.contributor.advisorSouza, Michael Ferreira de-
dc.contributor.authorBatista, Fernando do Carmo-
dc.date.accessioned2024-10-01T12:00:30Z-
dc.date.available2024-10-01T12:00:30Z-
dc.date.issued2024-02-27-
dc.identifier.citationBATISTA, Fernando do Carmo. Uma busca probabilística para o problema de geometria de distâncias moleculares. 2024. 48 f. Dissertação (Mestrado em Modelagem e Métodos Quantitativos) - Centro de Ciências, Universidade Federal do Ceará, 2024.pt_BR
dc.identifier.urihttp://repositorio.ufc.br/handle/riufc/78336-
dc.description.abstractThe prediction of three-dimensional protein structures has been an area of intense research, addressed by several disciplines represented by bioinformatics. The present work proposes an innovative method for predicting protein structures based on a binary tree, called Frequency-Based Search (FBS). We carried out a statistical comparison of the efficiency of this method in relation to the Depth Search (DFS) method, using protein structures obtained by Nuclear Magnetic Resonance (NMR) available in the Protein Data Bank (PDB). The main objective is to evaluate the efficiency of these methods on subsequences of protein backbone atoms of sizes 5, 10, 15, 20 and 25, while investigating whether nature exhibits geometric preferences when folding. The computational results indicate that the FBS method outperforms the DFS method in at least 70% of the atom subsequences analyzed and suggest the existence of geometric preferences in proteins, as evidenced by the selected sample.pt_BR
dc.language.isopt_BRpt_BR
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.titleUma busca probabilística para o problema de geometria de distâncias molecularespt_BR
dc.typeDissertaçãopt_BR
dc.description.abstract-ptbrA predição de estruturas tridimensionais de proteínas tem sido uma área de intensa pesquisa, abordada por diversas disciplinas representadas pela bioinformática. O presente trabalho propõe um método inovador de predição de estruturas de proteínas baseado em árvore binária, denominado Pesquisa Baseada em Frequência (FBS). Realizamos um comparativo estatístico da eficiência deste método em relação ao método Pesquisa em Profundidade (DFS), utilizando estruturas de proteínas obtidas por Ressonância Magnética Nuclear (NMR) disponíveis no Banco de Dados de Proteínas (PDB). O objetivo principal é avaliar a eficiência desses métodos em subsequências de átomos do backbone proteico de tamanhos 5, 10, 15, 20 e 25, enquanto investigamos se a natureza exibe preferências geométricas ao enovelar-se. Os resultados computacionais indicam que o método FBS supera o método DFS em pelo menos 70% das subsequências de átomos analisadas e sugerem a existência de preferências geométricas nas proteínas, conforme evidenciado pela amostra selecionada.pt_BR
dc.title.enA probabilistic search for the geometry problem of molecular distancespt_BR
dc.subject.ptbrÁrvore bináriapt_BR
dc.subject.ptbrEstrutura tridimensional de proteínapt_BR
dc.subject.ptbrProblema de Geometria de Distância Molecularpt_BR
dc.subject.enBinary treept_BR
dc.subject.enProtein three-dimensional structurept_BR
dc.subject.enGeometric Molecular Distance Problempt_BR
local.author.latteshttp://lattes.cnpq.br/5022342588509702pt_BR
local.advisor.orcidhttps://orcid.org/0000-0001-6751-2877pt_BR
local.advisor.latteshttp://lattes.cnpq.br/1246776718921674pt_BR
local.date.available2024-02-27-
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